本系教學目標著重於『就業、進修』雙軌並重，所以畢業生除了國家考試表現良好外，升學意願也非常高昂，94~96學年度，除服兵役者以外，五成左右應屆畢業生選擇繼續攻讀研究所，大多選擇清大生醫工程暨環境科學所、陽明醫學影像暨放射科學所或本校甫成立之醫學物理暨影像科學所。另外，根據統計校友資料調查之結果，除繼續在學及服役中之校友外，絕大多數之校友皆從事放射相關職業。